Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно)




Скачать 194.69 Kb.
НазваниеОдномерный эксперимент ямр 1H (подробно)
Дата24.09.2012
Размер194.69 Kb.
ТипДокументы
Ф.В. Тоукач “Основные ЯМР-эксперименты”

Частичный перевод версии 3.12

Центр ЯМР ИОХ РАН, спектрометр ЯМР Bruker AC200, программа DISNMR 94

_____________________________________________________________________________


* Названия команд, ручек управления, имена файлов приведены заглавными буквами

* Память компьютера разделена на три блока, в каждом из которых могут одновременно выполняться процессы, не требующие одного и того же ресурса. Большинство команд действует только в текущем блоке . Команды 1, 2 ил 3 изменяют этот текущий блок.

* Команды WR <имя файла> и RE <имя файла> (соответственно) записывают на диск или читают с диска содержимое текущего блока. Последние несохраненные специально данные из каждого блока автоматически записываются системой в файлы SPCx (спектр) и FIDx (FID), где x - номер блока.


Одномерный эксперимент ЯМР 1H (подробно)


A. Предварительные операции

1. Включить дисплей, помпу, перезагрузить компьютер клавишей START, если необходимо.

2. Прогреть или перемешать образец, вставить его в турбинку, поместить турбинку в спектрометр, включив воздушный лифт.

3. Если температура эксперимента отличается от 297K, включить блок контроля температуры. Желаемая температуры устанавливается с помощью клавиш на блоке или с клавиатуры командой TE. Для нагрева образца необходимо включить печку (HEATER) (каждое деление равняется приблизительно 10 градусам), для охлаждения - испаритель азота (N2 EVAPORATOR). Разрешение обычно бывает лучше при большей температуре, особенно в вязких растворителях (из-за уменьшения вязкости раствора при нагревании). Шкала ERROR SIGNAL отражает степень соответствия реальной температуры желаемой. Чем выше требования к разрешению, тем больше времени нужно давать на термостабилизацию (до получаса для прецизионных экспериментов). Увеличение потока воздуха (GAS FLOW) убыстряет термостабилизацию, но тогда воздуха может не хватить на вращение, либо образец выдует из датчика.

4. EDIT OPERATOR.ASC редактирует файл OPERATOR.ASC, который должен содержать следующие поля (заканчиваются точкой с запятой) Opr.: <имя оператора>, Solv.: <растворитель> и, возможно, Prep.: <имя препаратора>. Стирание символа в редакторе - Ctrl-S, выход с сохранением ESC-S.


B. Настройка разрешения

1. RSH <имя файла> - прочитать значения токов в градиентных катушках с диска, если нужно. Имена файлов (с расширением SHIM) отражают, как правило, растворитель, температуру и датчик (DMSO.SHIM, D2OSEL.SHIM, ACET313.SHIM и т.д.)

2. Найти сигнал дейтерия и, изменяя FIELD (поле), поместить его на центр экрана. Внешний вид сигнала можно менять с помощью LOCK PHASE (фаза), SWEEP AMPLITUDE и LOCK POWER. Все, что связано с работой lock’а, отображается на экране красной кривой, которую можно включить или выключить, нажимая Ctrl-L.

3. LOCK ON - включить систему дейтериевой стабилизации (lock). Если светодиод LOCK мигает значит система не может найти сигнал дейтерия - тогда можно попробовать временно увеличить LOCK POWER (мощность облучения), уменьшить SWEEP RATE (скорость прохождения) или слегка поварьировать FIELD.

4. LOCK POWER должен быть достаточно большим для стабильной работы lock’а, но не слишком большим - иначе сигнал дейтерия будет насыщаться, что выражается в постоянно меняющемся уровне lock’а.

5. Настроить градиенты X, Y, XZ, YZ, если нужно, заканчивать на X и Y. Неправильная настройка стоячих градиентов вызывает боковые линии на расстоянии от сигналов, кратном частоте вращения.

6. SPIN ON - включить вращение. Если образец не вращается (мигает светодиод) можно уменьшить GAS FLOW или немного подвытащить образец из турбинки. Частота вращения регулируется с помощью SPIN RATE.

7. Установить LOCK GAIN (усиление приемника lock’а) в такое значение, чтобы линия, отражающая уровень lock’а была на экране, делать это и дальше, когда потребуется.

8. Настроить пару градиентов Z - Z2 для получения максимального уровня lock’а, затем настроить пару Z - Z3 и снова Z - Z2. Критерии разрешения - уровень lock’а (красная кривая) и площадь и форма FID’а. При накоплении без суммирования (командой GS) площадь FID’а выводится во второй строке экрана.

Алгоритм настройки градиентов (на примере пары Z - Z2):

Изменить Z2 в любую сторону, независимо оттого, как это влияет на разрешение, затем попробовать снова найти максимум по Z. Если результат получился лучше, чем до изменения Z2, значит Z2 изменялся в нужном направлении, если хуже - значит нужно было изменять Z2 в противоположную сторону. Снова изменить Z2 в соответствующую сторону, но с меньшим шагом и т.д.

Неправильная настройка градиентов Z и Z3 вызывает симметричные искажения формы линии, неправильная настройка Z2 и Z4 - несимметричные (“плечи”). В случае Z3 и Z4 искажения проявляются ближе к основанию.

9. Понравившиеся значения токов в градиентных катушках можно записать на диск командой WSH <имя файла с расширением .SHIM>.


C. Инициализация

1. RJ <имя файла> - прочитать параметры эксперимента из файла; стандартные имена файлов - ACET.1, CDCL3.1, DMSO.13, C13DUAL.1 и т.д. Можно создавать свои собственные файлы, записывая текущие параметры на диск командой WJ <имя файла>. Файлы могут храниться на разных дисковых устройствах, обозначаемых D1, D2 и т.д. Если устройство не совпадает с текущим, оно указывается после имени файла со знаком равенства (например, MYFILE.1=D7). Текущее устройство изменяется командой DU.

2. Ввести названия образца с помощью лазерного сканера или команды TI. Название должно содержать символ ‘/’, затем имя директории, имеющейся на сервере (из четырех букв), затем пробел и имя образца (любое).

3. RGA автоматически определяет усиление приемника (RG). Если концентрация не меняется от образца к образцу, эту медленную операцию можно пропустить. RG должно быть таким, чтобы при Y-увеличении, равном 1K, первая точка первого скана FID’а не выходила за пределы двух клеточек на экране. Если это условие не выполняется после RGA, стоит уменьшить длительность импульса (см. 8). Можно устанавливать усиление приемника вручную командой RG - сделать побольше, если интересуют маленькие сигналы в присутствии одного большого (растворителя), или поменьше, если получается синусоидальная базовая линия.

4. PJ <имя файла> в блоке, где будет происходить обработка. (Прочитать параметры обработки).

5. Проверить значения следующих параметров (и поменять, если нужно)

6. TD определяет размер матрицы, в которую производится запись накопленных данных (обычно 8К или 16 К). Чем меньше TD, тем быстрее накопление, но хуже цифровое разрешение (pt/Hz). SI определяет размер матрицы для обработки (2n, обычно 16K). Если SI больше TD, остаток заполняется нулями - иногда это улучшает вид спектра.

7. RD - релаксационная задержка. Чем меньше молекула и чем более текуч растворитель, тем больше время релаксации. Для средних молекул оптимальная длина цикла (AQ (время накопления)+RD) составляет около трех секунд. При недостаточном RD, интеграл может быть неточным.

8. PW определяет длину импульса в микросекундах. Для обычных протонных экспериментов используется 30-градусный импульс (2-3 мсек).

9. NS - количество накоплений (обычно 8 или 16, так или иначе, кратное 8). -1 означает бесконечное накопление, пока не будет прервано.


D. Накопление

ZG и подождать, пока будет сделано нужное количество сканов (если NS = -1). ZG обнуляет содержимое текущего блока (ZE), затем запускает серию сканов (GO), каждый из которых - это последовательность PW-FIXD-DE-AQ-RD.


E. Выбор области и другие операции

В рутинных экспериментах используются стандартные положение (O1) и ширина (SW) спектрального окна, читаемые из файла командой RJ. Следующие шаги - один из способов изменения этих параметров.

1. TR <номер блока> - скопировать данные в другой блок для обработки.

2. Команда PASC SEND посылает данные из блока на сервер, используя заголовок, указанный в TI - полезно перед преобразованием Фурье.

3. FT - преобразование Фурье.

4. Редактирование фазы и приписывание хим. сдвига - см. ниже (пока пропущено).

5. Вывести на экран часть спектра, которую нужно накапливать. Сигналы, не попавшие в спектральное окно (при накоплении) могут отражаться от его краев из-за несовершенства полосового фильтра, особенно большие или близко расположенные. В редакторе EP ручка A двигает спектр горизонтально, ручка B сжимает и растягивает его, ручки C (грубо) и D (плавно) перемещают курсор. Ctrl-R вызывает на экран весь спектр. R фиксирует курсор, а, будучи нажато второй раз, выводит часть спектра между двумя курсорами.

6. Ctrl-O, нажатые в редакторе EP, пересчитывают ширину (SW) и положение (O1, относительно рабочей частоты спектрометра (SF)) спектрального окна (и то, и другое в Гц), затем происходит выход из EP.

7. Ctrl-H - прервать накопление.

8. TR <номер блока> - скопировать данные в блок, где будет идти накопление. Чтобы не перезаписать остальные параметры в этом блоке O1 и SW можно установить вручную. Если SW сильно отличается от стандартного, нужно указать новые значения TD и SI, ориентируясь по времени накопления, которое равно TD/2SW.

9. ZG и подождать, пока пройдет достаточное количество сканов.


F. Редактирование спектра

1. TR <номер блока> - скопировать данные в другой блок для обработки.

2. Проверить и, если нужно, установить параметры для умножения на взвешивающие функции. При Гауссовом умножении (улучшения разрешения) LB определяет степень обужения сигнала (приблизительно в Гц) (обычно от -0.3 до -2.0), а GB определяет, насколько резко происходит коррекция (обычно от 0.1 до 0.5). При умножении на экспоненту (улучшение отношения сигнал/шум) LB определяет степень уширения линий (обычно от 0.5 до 4.0), а GB не используется.

3. GM (Гауссово умножение) или EM (умножение на экспоненту).

4. FT - преобразование Фурье; EF=EM+FT, GF=GM+FT.

5. PK - автоматическая коррекция фазы (использует значения PHZ0 и PHZ1, косвенно вводимые при коррекции фазы вручную); EFP=EM+FT+PK, GFP=GM+FT+PK.

6. EP - вызвать универсальный редактор; команды, разделенные точкой с запятой, могут составлять последовательность, например FT;PK;EP.

7. Скорректировать фазу сигналов. Коррекция с инициализацией и автоматическим подбором начального значения - клавишей Р, аддитивная - клавишей A. Обе подпрограммы находят самый большой сигнал на экране и принимают его за реперную точку. Фаза этого сигнала (нулевого порядка) изменяется вращением ручки С (Комбинации Ctrl-C/D изменяют направление вращения ручек C/D на противоположное). Фаза остальных сигналов (первого порядка) изменяется вращением ручки D; ручки A and B работают, как обычно. Чем дальше сигнал от реперной точки, тем сильнее ручка D влияет на его фазу. Клавиша М осуществляет выход из подпрограммы с запоминанием, ВВОД - без запоминания.

8. Осуществить привязку шкалы, если она неправильная (шкалу можно отобразить, нажав Е) - поставить курсор на сигнал, хим. сдвиг которого известен, затем нажать G и ввести значение хим. сдвига в милионных долях (P) или в Гц (H). Текущий хим. сдвиг курсора отображается в центре первой информационной строки - между хим. сдвигами точек на краях экрана. Если найти реперный сигнал не удается, можно откалибровать шкалу, изменяя значение параметра SR (оно зависит от используемого датчика, температуры, растворителя, типа эксперимента).

9. Если нужно подписывать сигналы при выводе, установить минимальный уровень сигнала для выделения его, именно как сигнала, командой M (в EP).

10. Иногда полезно установить высоту (в см, при выводе) определенного сигнала - это делается командой CY (в EP), после которой вводится высота сигнала, на вершине которого стоит курсор и, затем, ширина спектра при выводе (в см).

11. ВВОД - выход из EP.

12. ABC или ABS корректирует базовую линию автоматически.

13. Для ручной коррекции базовой линии: запустить EP и найти в середине (по вертикали) шумовой полосы, нажать LINEFEED и указать имя файла. Затем найти подходящее число других точек в центре шумовой полосы, нажимая LINEFEED в каждой. W заканчивает процедуру ввода точек и спрашивает тип корректирующей функции, заданной точками: сплайн (S) или многочлен (P).

14. AZF <имя файла> интегрирует спектр и записывает автоматически расставленные точки сброса интеграла в указанный файл. При этом используются параметры AZFE (обычно 20) и AZFW (обычно 40).

15. Расстановка точек сброса вручную: вызвать EP и войти в подпрограмму интегрирования, нажав I. Нажатие L приводит к тому же результату, но точки сброса заранее читаются из файла, имя которого программа просит указать. Двигая курсор по спектру, определить все точки сброса, нажимая Z в каждой. ‘+‘ и ‘-’ масштабируют интеграл вертикально, A калибрует численные значения интеграла между текущими точками сброса (курсор должен находиться на вершине интегральной кривой). Сохранить интеграл на диск нажатием E, после чего программа спрашивает имя файла для сохранения точек сброса. Нажатие ВВОД означает использование имени по умолчанию: INTx.001, где х - номер блока.


G. Вывод

1. Вывести на экран часть спектра, которую нужно распечатать (самый простой способ - Ctrl-R, затем R два раза, двигая курсор между разами), затем нажать U для запоминания (видимой реакции при этом не наблюдается).

2. После выхода из EP выбрать и настроить устройство вывода командой CA (за этим следует диалог), если это не сделано ранее или автоматически при загрузке.

3. DPO и отвечать на вопросы диалога, например offset=0.5 (расстояние между спектром и шкалой), mark separation=0.1P (цена деления). Если параметр offset имеет величину, большую 2.5, то при выводе интеграла между спектром и шкалой выводятся его численные значения.

4. CX и указать ширину области вывода в см. (если не указано в EP)

5. CY и указать высоту области вывода в см. (если не указано в EP). Если CY = 0, для определения высоты спектра при выводе будет использоваться текущее значение увеличения по вертикали (управляется клавишами '+' и '-' в правой части клавиатуры).

6. MAXY и указать предел по вертикали. Если высота сигналов превышает этот предел, они обрезаются.

7. Если требуется, установить горизонтальное и вертикальное смещение нулевой точки с помощью команд X0 и Y0.

8. PEN запускает диалог, определяющий размер символов и цвета различных частей картинки (актуально для вывода на плоттер).

9. В сложных случаях можно осуществить предварительный просмотр, перенаправив вывод на дисплей, установив параметр DSPL в значение 1; установка в 0 переадресует вывод обратно на принтер (или плоттер).

10. При выводе на принтер переадресовать вывод в соответствующий порт командой TOPL.

11. PX(U) выводит спектр, PXI <имя файла> выводит интеграл, используя точки сброса из указанного файла, PXB(U) <имя файла> выводит спектр и интеграл. Часть спектра, находящаяся на экране в EP может быть выведена нажатием S.

12. PASC <название программы, например BOX1HРAС> выводит рамку и значения некоторых параметров. При этом используется информация из файла OPERATOR.ASC.

13. Если используется плоттер, вывод начинается сразу же и может быть прерван комбинацией Ctrl-P-T, при использовании принтера вывод происходит в буфер, содержимое которого можно напечатать командой NP (при этом буфер очищается).

14. Для автоматического вывода используются пакетные программы LPL (без интеграла), LPLI (с интегралом с автоматической расстановкой точек сброса) или другие. Запуск программы - командой AU <имя программы>.


Особенности одномерного эксперимента ЯМР 1H с подавлением сигнала растворителя


1. Установить значения всех параметров, используемых программой SSHD.AU с помощью команды AS SSHD.AU:

D1=1.0 (время подавления растворителя),

S1=30L (мощность подавления растворителя, в случае недостаточного подавления можно увеличить до 26L),

D2=0.01, S2=63L (то же, но для пустого места),

RD, PW, DE - оставить как есть,

DS=2 (число пустых сканов),

NS=-1 (число накоплений).

2. С помощью команды FL отредактировать файл FQLIST.001, содержащий список частот:

1.) частота сигнала растворителя относительно SF (она отображается во второй информационной строке EP)

2.) частота пустого места, например, 7000 Гц

3.) END (вводится клавишей ESC)

3. Накопление стартуется командой AU SSHD.AU, при этом RG контролируется по первому скану.

4. Плохо подавленные сигналы можно убрать вручную с помощью последовательности (Ctrl/T, затем двигать точки вверх и вниз клавишами 1 и 2, затем Ctrl/S) в EP.


Особенности одномерных экспериментов на других ядрах


1. Имена файлов с параметрами отражают также и ядра (DUALC13.001, C13W, F19W, P31W и т.д.)

2. Для эксперимента ЯМР 13С MOD нужно установить в 1, RG - 1600 или 3200.

3. Для накопления с широкополосной развязкой от области резонанса протонов используется команда AU ZG.AU или ZG (в зависимости от спектрометра); для накопления без развязки - специальные программы, так как протоны предоблучаются для создания NOE.

4. Для уменьшения уровня шума обычно используется умножение FID’а на экспоненту.


Особенности одномерных экспериментов с использованием двойного резонанса


A. Прямой способ

1. Найти сигнал, от которого будет делаться развязка, и поместить курсор на его вершину (в EP).

2. Нажать O2 M, чтобы запомнить частоту декаплера.

3. Скопировать параметры (а именно O2) в блок, где будет идти накопление.

4. Установить мощность декаплера, изменяя параметр DP, например, в значение 20L (максимальная мощность для селективного двойного резонанса от протонов - 2L).

5. HD - включить декаплер.

6. RG должно быть таким, чтобы при Y-увеличении, равном 1К, первая точка первого скана не выходила за пределы двух клеточек на экране.

7. Все остальное - как в обычном протонном эксперименте. (ZG, Ctrl-H, и т.д.). Декаплер отключается командой PO.


B. Разностный двойной резонанс

1. Мощность декаплера (DP) устанавливается в районе 22L (до 25L для узких пиков). Низкая мощность облучения делает облучаемый сигнал широким - при вычитании на его фоне хорошо видно форму исходного сигнала.

2. NS определяет число сканов в каждой серии. Каждая серия - это накопление NS сканов спектра с облучением нужного сигнала, затем NS сканов спектра с облучением пустого места, затем их вычитание и сохранение результата.

3. С помощью AS DIF.AU ввести следующие параметры: D1=5M; PW, RD, DE - как есть; DS=0.

4. Список частот (редактируется командой FL <имя файла, например FQLIST.001>) должен содержать следующее:

1.) Частота пустого места. Пустое место нужно выбирать достаточно близко к облучаемому сигналу, но не ближе 50 Гц от любого сигнала в спектре, лучше с той стороны от облучаемого сигнала, где не ожидается изменений за счет двойного резонанса.

2.) Частота облучаемого сигнала в Гц относительно SF.

5. Команда VС редактирует файл VCLIST.001, который должен содержать единственную строчку с указанием числа серий (обычно от 2 до 4).

6. Накопление стартуется командой AU DIF.AU.


C. Разностный двойной резонанс с подавлением растворителя

1. Установить значения всех параметров, используемых программой DIFSUP.AU с помощью команды AS DIFSUP.AU:

S1=30L (мощность подавления растворителя, в случае недостаточного подавления можно увеличить до 24L),

S2=22-25L (мощность облучения сигнала, см. В-1)

NE= число серий (обычно от 2 до 4),

NS=16 или 32 (число сканов в серии),

D1=1.0 (время подавления растворителя),

D2=0.01 (время облучения сигнала).

2. Требуется два списка частот (редактируются командой FL):

FQLIST.001: 1.) частота сигнала растворителя относительно SF

2.) частота пустого места. Пустое место нужно выбирать достаточно близко к облучаемому сигналу, но не ближе 50 Гц от любого сигнала в спектре, лучше с той стороны от облучаемого сигнала, где не ожидается изменений за счет двойного резонанса.

FQLIST.002: 1.) частота сигнала растворителя относительно SF

2.) частота облучаемого сигнала в Гц относительно SF.

3. Накопление стартуется командой AU DIFSUP.AU.


* Для чтения всех параметров двумерного эксперимента: RJ(2D) xx.PAR; RE xx.SER, для записи - WJ(2D) xx.PAR; WR xx.SER.


Двумерный эксперимент H/H-COSY


A. Постановка

1. Накопить одномерный протонный спектр и сохранить его на диск для использования в качестве проекции (удобнее использовать короткие имена и диск, выделенный для двумерных экспериментов - D2).

2. EP, выбрать область для COSY, Ctrl-O для запоминания SW и O1. Во избежание отражений лучше иметь дело со всем спектром, но, с другой стороны, большое SW негативно сказывается на времени эксперимента. Нужно всегда оставлять запас пустого места по краям от самых крайних сигналов, так как края 2D-поля часто бывают занижены, завышены или зашумлены.

3. Установить DU (текущее дисковое устройство) в значение D2.

4. ST2D (рассчитать параметры матрицы), затем постепенно изменять SI (начиная с 1K) так, чтобы цифровое разрешение (отображается на экране) стало не хуже 3 Hz/pt (чем меньше это значение, тем лучше разрешение).

5. NE=SI/4 (число серий), I2D=1 (отношение размерностей по осям; всегда 1 для симметричных матриц), MC2=M (magnitude spectrum).

WDW1=S, WDW2=S (функция обработки), SSB1=0, SSB2=0, ND0=1. Значения SI1 и SW1 не обязательно должны быть равны SI2 и SW2.

6. AS COSY.AU и ввести значения параметров:

D1=1,

P1=[1H-90°] (значение, соответствующее 90-градусному импульсу),

D0=3U,

    P2=[1H-90°] для обычного COSY или =[1H-45°] для COSY-45. Обычный эксперимент COSY обладает большей чувствительностью, поэтому используется, если концентрация мала или не хватает времени. COSY-45 дает лучшее разрешение вблизи диагональной линии. В отличие от обычного COSY, кросс-пики в COSY-45 представляют собой параллелограммы, наклоненные в сторону (      or      ), соответствующую знаку КССВ JH-H (2JH-H <0, 3JH-H >0). P2 можно установить в значение порядка [1H-65°], чтобы получить что-то среднее между COSY и COSY-45.

D2=5M,

RD=0, PW=0,

DE - как есть,

NS зависит от имеющегося времени (должно быть кратно 8 для COSY или кратно 16 для COSY-45),

DS=2 (количество пустых сканов в серии),

IN - как есть (должно отличаться от нуля),

7. TIME и подтвердить имя AU-программы, затем указать имя файла, например A.SER - в результате на экран будет выведено время эксперимента (EXPT работает быстрее, но менее точно).

8. AU, затем указать произвольное имя файла, например A.SER, после первого пустого скана вызвать EP и оценить усиление приемника (RG) - при Y-увеличении, равном 1К, первая точка первого скана не должна выходить за рамки двух клеточек на экране, но все же должна заметно отличаться от нулевой линии. Если нужно, уменьшить или увеличить RG и повторить шаг 8.

9. После установки правильного RG, запустить эксперимент командой AU, которая просит указать имя файла (с расширением .SER) для сохранения результата. Подождать пока эксперимент закончится (количество сделанных серий выводится в первой строке экрана, количество сканов в текущей серии - во второй). Если по каким-то причинам пришлось прервать эксперимент до его завершения, необходимо уменьшить TD1 до числа сделанных серий.


B. Обработка

10. ST2D и проверить WDW1, WDW2, SSB1, SSB2.

11. XFB и подождать конца двумерного преобразования Фурье (в первой строке экрана отобразится 'SMX 1').

* Для экономии времени можно предварительно проанализировать лишь ту часть данных, которая уже накоплена:

1.) WJ2D xxx.PAR - записать параметры эксперимента после их корректной установки

2.) AU, указать имя файла (xxx.SER) - начать накопление

3.) В другом блоке: RE xxx.SER, RJ2D xxx.PAR, XFT - преобразует FID, когда будет накоплено его достаточное количество. Можно также копировать данные в другой блок и варьировать там TD1.

12. SYM симметризует 2D-спектр относительно диагонали.

13. EP2D - это универсальный редактор для двумерных спектров

+/- растягивают 2D-спектр в третьем измерении (на нас)

Ручки C и D двигают курсор горизонтально и вертикально

R выводит горизонтальную одномерную проекцию (row),

C выводит вертикальную одномерную проекцию(column),

E запускает EP для текущей одномерной проекции, например для установки хим. сдвига

L позволяет определить координаты углов части двумерного спектра (для получения квадрата нужно нажать L два раза в таких местах, где Row=Column),

X выводит на экран выбранную часть двумерного спектра. При следующем вызове EP2D координаты углов инициализируются.

ESC-X - выход из EP2D.

14. Привязка вертикальной и горизонтальной шкал осуществляется путем запоминания параметра SR для одномерного 1H-спектра с последующей установкой в это значение параметров SR1 и SR2.

15. Непосредственный выбор границ области для вывода может быть осуществлен командой PLIM.

16. Непосредственный выбор уровней среза трехмерной картинки при выводе может быть осуществлен командой ILEV. Эти данные инициализируются каждый раз в момент вывода.

17. CX и CY определяют горизонтальный и вертикальный размеры поля вывода.

     DPO позволяет установить опции вывода в диалоге. Так как вместе с проекцией высота 2D-спектра больше его ширины, рекомендуется поворачивать картинку на 90 градусов.

Перед выводом лучше оценить результат, временно установив DSPL в 1 (для вывода на дисплей).

18. Если требуется, поменять Y-размер проекции: в другом блоке RE <имя файла со спектром-проекцией>, PJ <имя файла со спектром-проекцией>, CY = <новое значение высоты>, WR <то же имя файла>.

19. CPLP выводит 2D-спектр с проекцией вдоль одной оси, CP2P - с проекциями вдоль обеих осей. Обе команды инициируют диалог, в котором вводятся имена файлов с проекциями, число уровней среза, необходимость выводить рамку, сетку и т.д.


Особенности подавления сигнала растворителя в эксперименте H/H-COSY


1. AU-программа называется COSYHG.AU (HG означает H-gated).

2. параметр O2 нужно установить в значение частоты подавляемого сигнала относительно SF.

3. S1=30L, D3=5M, S2=30L (устанавливается через AS вместе с остальными параметрами).


Измерение 90-градусного импульса


1. Поместить курсор на вершину сигнала (обычно это - сигнал растворителя), разместив его по центру экрана (в EP).

2. Пересчитать SW и O1, нажав Ctrl-O. Лучше выбирать SW порядка 1000.

3. Уменьшить SI для экономии времени.

4. NS=1, PW=2.

5. ZG;FT;PK;EP и т.д. Первый раз сохранить фазу; фаза сигналов (после PK) при PW=1 и при PW=[1H-90°] не должна сильно отличаться. Для точного измерения, необходимо опять сохранить фазу, когда PW будет примерно соответствовать [1H-90°].

6. Постепенно увеличивая PW (вплоть до 50), повторять шаг 5. Когда PW примерно достигнет [1H-90°] установить параметр AI в 1. Когда сигнал начнет заметно уменьшаться, изменять PW с меньшим шагом. Если после PK сигнал переворачивается, уменьшать PW, если нет - увеличивать, пока сигнал почти не исчезнет, т.е. будет иметь вид              или                . Точность измерения - 0.2.

7. Сейчас PW соответствует [1H-180°]. Чем короче импульс [1H-90°], составляющий половину этого значения, тем лучше будет спектр.


Отличия двумерного эксперимента по наблюдению Ядерного Эффекта Оверхаузера (NOESY)


1. AU-программа называется NOESY для обычного эксперимента и NOESYHG.AU для эксперимента с подавлением сигнала растворителя.

2. Во избежания отражений и артефактов, нужно иметь дело только со всем спектром. Поскольку эксперимент NOESY менее чувствителен, он требует большего значения NS и, соответственно, большего времени.

3. Все остальное идентично постановке эксперимента COSY, кроме того:

P3=[1H-90°],

S3=30L,

D9= время смешения, обычно от 0.1 до 2.0 сек

V9= разброс времен смешения в процентах, для обеспечения возможности накопления сигналов взаимодействий, требующих разные времена смешения.

4. Обработка эксперимента отличается от обработки COSY тем, что SSB1 и SSB2 нужно установить в 2 или 4, в зависимости от того, что дает наилучший результат после XFB.



(C) Phyl Tou, 1993

IOCh NMR

ver 3.13 (1998 Apr)

Похожие:

Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconУтверждено Ученым советом
Непрерывная ямр спектроскопия. Принципы построения непрерывного ямр спектрометра, основные блоки спектрометра. Источники ошибок при...
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) icon«ямр томография»
Ввведение
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconЯмр томограф
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconЛабораторная работа №3 Обработка массивов
С помощью компонентов ListBox и StringGrid создайте приложения, обрабатывающие одномерный и двумерный массивы
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconС. В. Куценко Саратовский государственный университет
Если прикладываемая последовательность известна заранее, то такой эксперимент называется безусловным, в противном случае, если выбор...
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconШкольный физический эксперимент
Ч. Электрический ток в различных средах. М. Телекомпания сгу тв, 2006. 1 эл опт диск (dvd-rom) : цв. (Современная гуманитарная академия)....
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconМетодические указания к выполнению курсовых работ. Методика решения экспериментальных задач. Методика решения расчетных задач. Профильное обучение. Элективные курсы. Учебный эксперимент к теме «Углеводороды»
Учебный эксперимент при изучении кислород- и азотсодержащих органических соединений
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconЛитература абрагам А. Ядерный магнетизм. М.: Ил, 1963
Трофимов В. И., Лисин В. В., Сергеев Н. А., Киперман Е. М. Современные методы ямр и эпр в химии твёрдого тела. Черноголовка, 1979,...
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconТической модели термогазового воздействия на нефтяной пласт в вычислительном эксперименте
Х технологий разработки нефтяных месторождений является вычислительный эксперимент [1]. В настоящей работе компьютерный эксперимент...
Одномерный эксперимент ямр 1H (подробно) iconТема : Работа с массивами и матрицами в языке программирования
В программе используется одномерный целочисленный массив a с индексами от 0 до Ниже представлен фрагмент программы, записанный на...
Разместите кнопку на своём сайте:
Библиотека


База данных защищена авторским правом ©lib.znate.ru 2014
обратиться к администрации
Библиотека
Главная страница