Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов




НазваниеРоссийской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов
страница1/10
Дата27.01.2013
Размер0.63 Mb.
ТипАвтореферат
  1   2   3   4   5   6   7   8   9   10
На правах рукописи


УЧРЕЖДЕНИЕ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК ИНСТИТУТ БИООРГАНИЧЕСКОЙ ХИМИИ ИМ. АКАДЕМИКОВ М.М. ШЕМЯКИНА И Ю.А. ОВЧИННИКОВА РАН


Козлов Сергей Александрович

Тема: НОВЫЕ ПОДХОДЫ К ИЗУЧЕНИЮ СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНОГО РАЗНООБРАЗИЯ ПОЛИПЕПТИДНЫХ ТОКСИНОВ


Специальность 02.00.10 – Биоорганическая химия

АВТОРЕФЕРАТ

диссертации на соискание ученой степени

доктора химических наук

Москва – 2010


Работа выполнена в лаборатории нейрорецепторов и нейрорегуляторов Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова

Предполагаемые официальные оппоненты:

  • чл.-корр. РАН, доктор биологических наук, профессор Рысков Алексей Петрович Лаборатория организации генома Института биологии гена

  • доктор химических наук, профессор Юрий Николаевич Уткин Лаборатория молекулярной токсинологии Института биоорганической химии

  • доктор биологических наук Лисица Андрей Валерьевич Лаборатория биоинформационных технологий Института биомедицинской химии


Предполагаемая Ведущая организация:

Институт молекулярной генетики РАН

Предполагаемая дата защиты диссертации 30 марта 2011 г. на заседании Диссертационного совета Д 002.019.01 при Учреждение Российской академии наук институте биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

по адресу: 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10.


С диссертацией можно ознакомиться в научной библиотеке Института биоорганической химии


Автореферат разослан «___» _________ 2010 г.


Ученый секретарь

диссертационного совета В.А. Олейников

I.Общая характеристика работы

I.1.Актуальность проблемы


Современная биологическая наука характеризуется мощными технологическими прорывами, благодаря чему возросли темпы сбора и обработки биоинформации, ускорились процессы расшифровки структур новых биомолекул, активно разрабатываются и внедряются постгеномные технологии. Практическую ценность приобретает не просто накопление массивов данных о новых структурных единицах, но и их дальнейший анализ с использованием различных алгоритмов поиска функционально-значимых структур. Очевидно, что время «ручных» анализов безвозвратно ушло, поэтому, активно разрабатываются и внедряются многочисленные автоматизированные методы по работе с биоинформацией, в частности по анализу баз данных случайных нуклеотидных последовательностей – dbEST.

Настоящая работа посвящена изучению биологически активных молекул полипептидной природы, которые могут быть использованы в медицине, ветеринарии или агропромышленном комплексе. Интенсивный поиск новых активных белковых молекул проводится во всем мире с применением различного арсенала исследовательских средств. Для анализа собранных результатов существуют общие схемы обработки данных, отдельные приложения и автоматизированные программные комплексы. Однако, эффективность неспециализированных приложений очень низкая. Основываясь на общедоступных ресурсах белковых последовательностей (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein.) и баз данных EST, полученных самостоятельно или загруженных с сетевого ресурса NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucest), предложен новый эффективный алгоритм анализа, специализированный для поиска полипептидных токсинов.

Для поиска новых лекарственных средств идеально подходит яд животных – сложная многокомпонентная смесь различных биоактивных молекул. Созданный по принципу комбинаторной библиотеки яд одного вида животного может содержать от 10 до 500 различных компонентов. Таким образом, актуальными задачами исследования природных ядов являются, во-первых, характеристика структурного разнообразия различных компонентов, во-вторых, поиск соединений, которые обладают специфическим действием на представляющую интерес биологическую мишень.

I.1.1.Цели работы


Основной задачей работы является разработка и практическая апробация новых подходов для направленного поиска полипептидных структур.

Данные о новых структурах могут быть получены при проведении прямых исследований собранных образцов природных ядов. В этом случае используется техника постадийного фракционирования компонентов или протеомика цельного яда. Эффективным также является применение комбинации обеих технологий.

Более перспективный метод, дающий одновременно выверенные полипептидные последовательности компонентов яда, основан на анализе нуклеотидных последовательностей баз данных EST. Этот метод изучает транскриптом изучаемого образца и при наличии специально разработанных алгоритмов анализа позволяет идентифицировать большинство из имеющихся в яде полипептидов. Одной из основных целей работы является разработка специализированного алгоритма анализа EST банков последовательностей и методов предсказания зрелых полипептидных структур из ядов пауков.

В рамках работы проводился направленный поиск активных компонентов, имеющих (1) выраженную токсичность к насекомым, (2) способных эффективно подавлять рост микроорганизмов и (3) модулировать проводимость ионотропного ваниллоидного рецептора 1 (TRPV1).

  1   2   3   4   5   6   7   8   9   10

Похожие:

Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconИбх ран филиал учреждения российской академии наук
Учреждение Российской академии наук Институт биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconО Конкурсе молодых ученых
Учреждением Российской академии наук Институт биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран и Обществом...
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconМ. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран
Симпозиум проводится в здании Филиала Института биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран (конференц-зал)...
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconGangliosides and t-lymphocyte apoptosis
Группы липидных модуляторов иммунитета Отдела иммунологии Федерального государственного бюджетного учреждения науки Институт биоорганической...
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconПрограмма научной конференции по биоорганической химии и биотехнологии
Малый конференц-зал Института биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран, Москва
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconПрограмма VI московского международного конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития»
Институт биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconВ. Т. Иванов, директор Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран
Ран в. Т. Иванов, Институт биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран, Россия
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconПрограмма с тематикой и поступившими докладами VI московского международного конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития»
Институт биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов iconВ. М. Липкин, Т. В. Овчинникова международная научная конференция по биоорганической химии, биотехнологии и бионанотехнологии, посвященная 75-летию со дня рождения академика ю. А. Овчинникова
Академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова Российской академии наук (г. Москва) и Филиале Института (г. Пущино, Московская область)...
Российской академии наук институт биоорганической химии им. Академиков м. М. Шемякина и ю. А. Овчинникова ран козлов Сергей Александрович Тема: новые подходы к изучению структурно-функционального разнообразия полипептидных токсинов icon«Фармацевтические и медицинские биотехнологии»
Руководители: Мирошников А. И., академик ран, зам директора Института биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А....
Разместите кнопку на своём сайте:
Библиотека


База данных защищена авторским правом ©lib.znate.ru 2014
обратиться к администрации
Библиотека
Главная страница